Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MT-CO1P00395 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MT-CO1P00395 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms