Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX6O95947 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX6O95947 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX6O95947 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX6O95947 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX6O95947 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX6O95947 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX6O95947 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX6O95947 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX6O95947 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX6O95947 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX6O95947 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX6O95947 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX6O95947 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX6O95947 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX6O95947 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX6O95947 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX6O95947 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX6O95947 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX6O95947 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX6O95947 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX6O95947 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX6O95947 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX6O95947 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX6O95947 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX6O95947 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX6O95947 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX6O95947 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX6O95947 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX6O95947 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX6O95947 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX6O95947 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX6O95947 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX6O95947 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX6O95947 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX6O95947 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX6O95947 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX6O95947 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX6O95947 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX6O95947 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX6O95947 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX6O95947 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX6O95947 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX6O95947 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX6O95947 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX6O95947 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX6O95947 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX6O95947 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX6O95947 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX6O95947 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX6O95947 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX6O95947 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX6O95947 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX6O95947 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX6O95947 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX6O95947 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX6O95947 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX6O95947 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX6O95947 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX6O95947 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX6O95947 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBX6O95947 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBX6O95947 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX6O95947 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX6O95947 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX6O95947 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX6O95947 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX6O95947 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX6O95947 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX6O95947 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX6O95947 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX6O95947 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX6O95947 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX6O95947 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms