Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAPBO95292 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAPBO95292 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VAPBO95292 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAPBO95292 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAPBO95292 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAPBO95292 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAPBO95292 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPBO95292 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPBO95292 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPBO95292 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPBO95292 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPBO95292 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPBO95292 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPBO95292 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPBO95292 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPBO95292 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPBO95292 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPBO95292 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPBO95292 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPBO95292 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPBO95292 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPBO95292 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPBO95292 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPBO95292 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPBO95292 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPBO95292 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPBO95292 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPBO95292 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPBO95292 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPBO95292 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPBO95292 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPBO95292 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAPBO95292 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAPBO95292 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAPBO95292 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAPBO95292 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAPBO95292 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPBO95292 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPBO95292 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPBO95292 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPBO95292 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPBO95292 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPBO95292 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPBO95292 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAPBO95292 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAPBO95292 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAPBO95292 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAPBO95292 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPBO95292 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPBO95292 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPBO95292 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPBO95292 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPBO95292 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPBO95292 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPBO95292 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPBO95292 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPBO95292 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPBO95292 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPBO95292 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPBO95292 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPBO95292 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPBO95292 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPBO95292 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPBO95292 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPBO95292 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VAPBO95292 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAPBO95292 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAPBO95292 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAPBO95292 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAPBO95292 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAPBO95292 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAPBO95292 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAPBO95292 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAPBO95292 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms