Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX3O95076 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX3O95076 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX3O95076 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX3O95076 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX3O95076 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX3O95076 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX3O95076 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX3O95076 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX3O95076 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX3O95076 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX3O95076 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX3O95076 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALX3O95076 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX3O95076 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX3O95076 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALX3O95076 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX3O95076 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX3O95076 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALX3O95076 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALX3O95076 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX3O95076 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX3O95076 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALX3O95076 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX3O95076 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX3O95076 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX3O95076 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX3O95076 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX3O95076 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX3O95076 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX3O95076 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALX3O95076 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX3O95076 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX3O95076 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX3O95076 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX3O95076 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX3O95076 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALX3O95076 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALX3O95076 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX3O95076 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX3O95076 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX3O95076 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX3O95076 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX3O95076 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX3O95076 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX3O95076 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX3O95076 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX3O95076 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX3O95076 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX3O95076 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX3O95076 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX3O95076 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX3O95076 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX3O95076 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX3O95076 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX3O95076 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX3O95076 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX3O95076 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX3O95076 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX3O95076 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX3O95076 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX3O95076 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX3O95076 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX3O95076 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX3O95076 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX3O95076 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms