Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SLIT2O94813 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLIT2O94813 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SLIT2O94813 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLIT2O94813 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SLIT2O94813 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms