Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CIB2O75838 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CIB2O75838 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIB2O75838 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB2O75838 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB2O75838 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB2O75838 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB2O75838 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB2O75838 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB2O75838 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB2O75838 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB2O75838 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB2O75838 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB2O75838 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB2O75838 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB2O75838 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB2O75838 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB2O75838 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB2O75838 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB2O75838 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB2O75838 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB2O75838 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB2O75838 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB2O75838 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB2O75838 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB2O75838 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB2O75838 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB2O75838 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB2O75838 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB2O75838 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB2O75838 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB2O75838 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB2O75838 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB2O75838 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIB2O75838 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIB2O75838 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIB2O75838 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB2O75838 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB2O75838 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB2O75838 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB2O75838 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB2O75838 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB2O75838 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB2O75838 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB2O75838 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB2O75838 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB2O75838 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB2O75838 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB2O75838 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB2O75838 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB2O75838 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB2O75838 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB2O75838 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB2O75838 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB2O75838 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB2O75838 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB2O75838 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB2O75838 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB2O75838 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB2O75838 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB2O75838 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CIB2O75838 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CIB2O75838 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CIB2O75838 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB2O75838 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB2O75838 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB2O75838 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB2O75838 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB2O75838 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB2O75838 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB2O75838 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB2O75838 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB2O75838 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB2O75838 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB2O75838 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB2O75838 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms