Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPX2O60687 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRPX2O60687 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms