Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN1O60635 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN1O60635 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN1O60635 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms