Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCRIPO60506 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCRIPO60506 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNCRIPO60506 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms