Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD5O60279 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms