Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD21O60216 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD21O60216 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD21O60216 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD21O60216 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD21O60216 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD21O60216 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD21O60216 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD21O60216 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD21O60216 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD21O60216 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD21O60216 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD21O60216 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD21O60216 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD21O60216 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD21O60216 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD21O60216 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD21O60216 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD21O60216 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
RAD21O60216 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD21O60216 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD21O60216 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD21O60216 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD21O60216 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD21O60216 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD21O60216 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD21O60216 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD21O60216 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD21O60216 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD21O60216 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD21O60216 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD21O60216 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD21O60216 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD21O60216 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD21O60216 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD21O60216 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD21O60216 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD21O60216 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD21O60216 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD21O60216 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD21O60216 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD21O60216 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD21O60216 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD21O60216 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD21O60216 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD21O60216 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD21O60216 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD21O60216 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD21O60216 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD21O60216 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD21O60216 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD21O60216 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD21O60216 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD21O60216 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD21O60216 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD21O60216 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD21O60216 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD21O60216 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD21O60216 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD21O60216 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD21O60216 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD21O60216 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD21O60216 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD21O60216 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD21O60216 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD21O60216 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD21O60216 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD21O60216 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD21O60216 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD21O60216 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD21O60216 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD21O60216 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD21O60216 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD21O60216 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD21O60216 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD21O60216 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD21O60216 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD21O60216 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD21O60216 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD21O60216 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD21O60216 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD21O60216 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD21O60216 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD21O60216 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD21O60216 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD21O60216 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD21O60216 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD21O60216 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD21O60216 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD21O60216 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD21O60216 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD21O60216 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD21O60216 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD21O60216 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD21O60216 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD21O60216 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD21O60216 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD21O60216 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD21O60216 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD21O60216 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms