Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HTATSF1O43719 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HTATSF1O43719 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1O43719 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms