Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLOCKO15516 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLOCKO15516 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLOCKO15516 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms