Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK1O15075 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLK1O15075 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCLK1O15075 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK1O15075 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms