Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFKBIEO00221 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
NFKBIEO00221 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFKBIEO00221 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms