Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C0C1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C0C1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0C1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0C1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0C1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0C1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0C1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0C1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0C1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0C1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0C1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0C1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0C1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0C1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0C1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0C1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0C1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0C1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0C1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0C1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0C1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C0C1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C0C1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C0C1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C0C1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H7C0C1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H7C0C1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0C1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0C1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0C1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0C1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0C1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0C1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0C1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0C1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0C1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0C1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0C1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0C1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0C1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0C1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0C1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0C1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0C1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0C1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H7C0C1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H7C0C1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H7C0C1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H7C0C1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0C1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0C1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0C1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0C1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0C1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H7C0C1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
H7C0C1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H7C0C1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H7C0C1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0C1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0C1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0C1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0C1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0C1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0C1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0C1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0C1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0C1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0C1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0C1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0C1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0C1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0C1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0C1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0C1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0C1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0C1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0C1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0C1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0C1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0C1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0C1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0C1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0C1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0C1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H7C0C1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H7C0C1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0C1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0C1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0C1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0C1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0C1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0C1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0C1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0C1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H7C0C1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms