Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BSA7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BSA7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BSA7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BSA7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BSA7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BSA7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSA7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSA7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSA7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSA7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSA7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSA7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSA7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSA7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSA7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSA7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSA7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSA7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSA7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSA7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSA7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSA7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSA7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSA7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSA7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSA7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSA7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSA7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSA7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSA7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSA7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSA7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSA7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSA7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSA7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSA7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSA7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSA7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSA7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSA7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSA7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSA7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSA7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSA7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSA7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSA7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSA7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSA7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSA7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSA7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BSA7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BSA7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BSA7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSA7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSA7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSA7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSA7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSA7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSA7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSA7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BSA7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BSA7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BSA7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSA7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSA7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSA7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSA7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSA7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSA7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSA7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSA7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BSA7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BSA7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BSA7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BSA7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BSA7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSA7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSA7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSA7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSA7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSA7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms