Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
H3BQV1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
H3BQV1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H3BQV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H3BQV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H3BQV1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H3BQV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H3BQV1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H3BQV1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BQV1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BQV1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BQV1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BQV1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BQV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BQV1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BQV1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
H3BQV1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H3BQV1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
H3BQV1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
H3BQV1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H3BQV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BQV1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BQV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BQV1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BQV1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BQV1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BQV1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BQV1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BQV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BQV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BQV1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQV1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQV1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQV1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQV1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQV1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQV1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQV1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H3BQV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H3BQV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H3BQV1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BQV1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BQV1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BQV1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BQV1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
H3BQV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
H3BQV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H3BQV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
H3BQV1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BQV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BQV1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BQV1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BQV1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BQV1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BQV1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BQV1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H3BQV1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
H3BQV1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BQV1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BQV1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BQV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BQV1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BQV1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BQV1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BQV1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BQV1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BQV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
H3BQV1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BQV1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BQV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
H3BQV1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BQV1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BQV1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BQV1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BQV1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BQV1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BQV1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BQV1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BQV1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BQV1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BQV1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms