Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms