Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LH3BP13 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms