Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BM21 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BM21 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BM21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BM21 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BM21 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BM21 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BM21 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BM21 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BM21 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BM21 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BM21 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BM21 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BM21 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BM21 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BM21 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BM21 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BM21 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BM21 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BM21 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BM21 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BM21 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BM21 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BM21 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BM21 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BM21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BM21 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BM21 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BM21 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BM21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BM21 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BM21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BM21 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BM21 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BM21 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BM21 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BM21 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BM21 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BM21 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BM21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BM21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BM21 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BM21 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BM21 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BM21 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BM21 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BM21 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BM21 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BM21 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BM21 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BM21 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BM21 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BM21 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BM21 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BM21 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BM21 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BM21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BM21 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BM21 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BM21 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BM21 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BM21 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BM21 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BM21 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BM21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BM21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BM21 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BM21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BM21 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BM21 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BM21 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BM21 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BM21 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BM21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BM21 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms