Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms