Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMG1C9JSJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHMG1C9JSJ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms