Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L5A8MUK1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L5A8MUK1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L5A8MUK1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms