Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC169A6NNP5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC169A6NNP5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC169A6NNP5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms