Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN24A6NM45 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms