Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L1PA6NM43 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT8L1PA6NM43 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms