Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NIN4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NIN4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NIN4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NIN4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NIN4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NIN4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NIN4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NIN4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NIN4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NIN4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NIN4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NIN4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NIN4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NIN4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NIN4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NIN4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NIN4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NIN4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NIN4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NIN4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NIN4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NIN4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NIN4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NIN4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NIN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NIN4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NIN4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NIN4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NIN4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NIN4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NIN4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NIN4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A6NIN4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A6NIN4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A6NIN4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NIN4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NIN4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NIN4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NIN4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A6NIN4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NIN4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NIN4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NIN4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NIN4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A6NIN4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NIN4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A6NIN4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NIN4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A6NIN4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NIN4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A6NIN4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NIN4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NIN4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NIN4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NIN4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NIN4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NIN4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NIN4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NIN4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NIN4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NIN4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A6NIN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A6NIN4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A6NIN4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NIN4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NIN4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms