Protein–RNA interactions for Protein: A6NI03

TRIM64B, Putative tripartite motif-containing protein 64B, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64BA6NI03 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM64BA6NI03 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM64BA6NI03 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM64BA6NI03 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms