Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQJ5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PQJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A1W2PQJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PQJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms