Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms