Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0J9YYE9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0J9YYE9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0J9YYE9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YYE9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms