Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT12Q53H54 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms