Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MECP2-211ENST00000496908 342 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.176e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.36e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.316e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.476e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.76e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-212ENST00000611468 603 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.736e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-202ENST00000369957 784 ntTSL 39.5□□□□□ -0.896e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-204ENST00000415944 413 ntTSL 58.11□□□□□ -1.116e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-220ENST00000631210 490 ntTSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.146e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 TPTEP1-201ENST00000383140 971 ntTSL 1 (best)7.64□□□□□ -1.196e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-219ENST00000630151 322 ntTSL 55.67□□□□□ -1.56e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-223ENST00000637791 101 ntTSL 54.6□□□□□ -1.676e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-222ENST00000637533 140 ntTSL 51.68□□□□□ -2.146e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 26.82□□□□□ -1.322e-7■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 24.52□□□□□ -1.692e-7■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.186e-8■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.426e-8■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 418.72■□□□□ 0.598e-17■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 46.77□□□□□ -1.338e-17■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 45.19□□□□□ -1.588e-17■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 NUP214-227ENST00000531929 593 ntTSL 42.61□□□□□ -1.991e-8■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 NUP214-212ENST00000524578 524 ntTSL 32.4□□□□□ -2.031e-8■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 FBXW2-203ENST00000476481 661 ntTSL 319.78■□□□□ 0.763e-7■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 XPO5-204ENST00000424378 624 ntTSL 34.12□□□□□ -1.753e-9■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 XPO5-210ENST00000496341 800 ntTSL 53.6□□□□□ -1.833e-9■□□□□ 11.1
TARDBPQ13148 NAPB-204ENST00000468128 782 ntTSL 522.04■■□□□ 1.125e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.765e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 DKC1-208ENST00000475423 587 ntTSL 216.87■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.25e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.055e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.085e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ZNF100-205ENST00000598026 588 ntTSL 413.63□□□□□ -0.235e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 213.16□□□□□ -0.35e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.35e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 412.3□□□□□ -0.445e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.455e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 KCNJ15-217ENST00000549805 740 ntTSL 311.76□□□□□ -0.535e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.625e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ACTR3C-204ENST00000478393 5697 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.655e-6■□□□□ 11
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TARDBPQ13148 KCNJ15-216ENST00000549158 626 ntTSL 310.67□□□□□ -0.75e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ZNF100-206ENST00000608416 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.75e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 29.99□□□□□ -0.815e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ATXN2-212ENST00000492467 887 ntTSL 59.93□□□□□ -0.825e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 KCNJ15-214ENST00000547595 313 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 KCNJ15-218ENST00000549932 555 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 KCNJ15-219ENST00000551422 413 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 KCNJ15-215ENST00000548700 304 ntTSL 39.86□□□□□ -0.835e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 DKC1-207ENST00000473552 656 ntTSL 29.28□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.025e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ZNF100-204ENST00000596452 464 ntTSL 38.57□□□□□ -1.045e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.075e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ATXN2-220ENST00000550236 704 ntTSL 58.37□□□□□ -1.075e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.125e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ATXN2-208ENST00000481331 381 ntTSL 37.71□□□□□ -1.185e-6■□□□□ 11
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TARDBPQ13148 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.265e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ANAPC4-205ENST00000505842 636 ntTSL 35.2□□□□□ -1.585e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.645e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -25e-6■□□□□ 11
TARDBPQ13148 FNDC3B-208ENST00000476794 682 ntTSL 37.32□□□□□ -1.245e-8■□□□□ 11
TARDBPQ13148 FNDC3B-209ENST00000478016 554 ntTSL 43.51□□□□□ -1.855e-8■□□□□ 11
TARDBPQ13148 PICALM-205ENST00000526548 738 ntTSL 1 (best)5.35□□□□□ -1.553e-6■□□□□ 10.9
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TARDBPQ13148 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 24.33□□□□□ -1.726e-7■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -03e-11■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.313e-11■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 UHMK1-201ENST00000282169 3345 ntTSL 29.39□□□□□ -0.913e-11■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.013e-11■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 ZNF331-204ENST00000502248 670 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.653e-8■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-8■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 NKTR-210ENST00000466553 716 ntTSL 25.3□□□□□ -1.562e-12■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.17□□□□□ -2.062e-12■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 TTC17-214ENST00000534347 889 ntTSL 316.14■□□□□ 0.171e-6■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.593e-9■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)23.6■■□□□ 1.373e-7■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.053e-7■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-7■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.863e-7■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 38.71□□□□□ -1.023e-7■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-7■□□□□ 10.9
TARDBPQ13148 SMIM7-217ENST00000599310 1123 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-214ENST00000597711 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-220ENST00000602194 534 ntTSL 310.23□□□□□ -0.771e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-204ENST00000461488 569 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-209ENST00000487803 2190 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.861e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-221ENST00000627144 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-205ENST00000463051 602 ntTSL 39.31□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-219ENST00000600740 580 ntTSL 38.71□□□□□ -1.021e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-201ENST00000358726 850 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-202ENST00000397349 1122 ntTSL 28.09□□□□□ -1.111e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-212ENST00000594507 430 ntTSL 37.91□□□□□ -1.141e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-203ENST00000461364 601 ntTSL 27.13□□□□□ -1.271e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SMIM7-210ENST00000593404 1065 ntTSL 25.42□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-8■□□□□ 10.8
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