Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CAMTA1Q9Y6Y1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMTA1Q9Y6Y1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CAMTA1Q9Y6Y1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms