Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NR2E3Q9Y5X4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NR2E3Q9Y5X4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR2E3Q9Y5X4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR2E3Q9Y5X4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NR2E3Q9Y5X4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR2E3Q9Y5X4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR2E3Q9Y5X4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR2E3Q9Y5X4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms