Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF1Q9Y4C2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF1Q9Y4C2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCAF1Q9Y4C2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCAF1Q9Y4C2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF1Q9Y4C2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF1Q9Y4C2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms