Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GINS2Q9Y248 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GINS2Q9Y248 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms