Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEU3Q9UQ49 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEU3Q9UQ49 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms