Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.42
SETD1BQ9UPS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SETD1BQ9UPS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETD1BQ9UPS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SETD1BQ9UPS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SETD1BQ9UPS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms