Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRQQ9UMZ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRQQ9UMZ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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