Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNPO2Q9UMS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms