Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID1Q9ULK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRID1Q9ULK0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms