Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL1Q9UKG1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL1Q9UKG1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8528.3 ms