Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC6Q9UBN7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC6Q9UBN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms