Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1A2

PPP4R1L, Putative serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1LQ9P1A2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R1LQ9P1A2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP4R1LQ9P1A2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R1LQ9P1A2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R1LQ9P1A2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms