Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23BQ9NYZ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TVP23BQ9NYZ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23BQ9NYZ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms