Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD5Q9NXV2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD5Q9NXV2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCTD5Q9NXV2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms