Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPEP1Q9NXJ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms