Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLN6Q9NWW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLN6Q9NWW5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN6Q9NWW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.1 ms